骨龄的应用范围非常广泛，凡涉及儿童青少年生长发育的领域几乎都要用到骨龄。但就儿童青少年矮身高来说，骨龄有下面三大用途：
为何儿童青少年的身高增长随年龄增长而不断下降？近些年来，研究认为其根本机制在生长板内（长骨骺与骨干之间的软骨组织），生长板存在固有的程序性变化，随年龄的增长生长板出现功能性的衰老变化和组织性的衰老变化，并将这种变化称为“生长板衰老”。因骨龄评价与生长板结构性变化存在密切的关系，所以骨龄可作为生长板衰老的标志。
矮身高儿童通常发育延迟，所以使骨龄更适合于估价剩余的生长潜力。例如，男孩在骨龄12-13岁出现身高生长速度高峰，骨龄15岁后生长减慢，身高剩余潜力在2-4cm，16岁接近成年身高；女孩在骨龄10-11岁出现身高速度高峰，13岁以后生长减慢，剩余潜力在3-6cm，15岁接近成年身高。
骨龄的延迟和提前程度可以帮助分析儿童身高生长异常的病因，因此在生长发育异常疾病的诊断与治疗中都要定期拍摄手腕部x线片，评价骨龄。在继发性的生长疾病以及许多特发性矮身高（矮身材）儿童，骨龄通常延迟；而大部分原发性疾病（例如综合症，骨发育异常等）骨龄延迟较少。
⑴ 大部分矮身高儿童无明显病因，而称为特发性矮身高（iss）。其中包括家族性矮身高。当依据身高确定了矮身高儿童为家族性矮身高之后，可以根据骨龄再进行分析，如果骨龄发育正常则可确定为家族性矮身高，但当骨龄延迟时则为体质性生长延迟（这类儿童依据骨龄评价的身高正常）。
⑵ 辅助病因诊断：在矮身高儿童的鉴别诊断过程中，如果骨龄不延迟实际上可排除生长激素（gh）缺乏。骨龄发育提前是性早熟和先天性肾上腺增生疾病的重要临床表现。骨龄是否提前也是乳房初长过早和阴毛出现过早鉴别诊断中的重要参考指标。
骨龄不仅用于评价儿童身高生长的延迟、提前或青春期延迟，而且也广泛用于影响儿童生长发育疾病的治疗监测。
⑴ 用于决定性腺功能减退儿童开始替代治疗的正确时间。
⑵ 用于决定性早熟和先天性肾上腺增生疾病儿童是否治疗。
⑶ 在几乎所有影响儿童生长发育疾病的治疗中都要应用骨龄和预测身高来监测骨成熟度反应和对成年身高的影响。
例如生长激素缺乏、小于孕龄儿出生的矮身高、特纳综合症、特发性矮身高等儿童的治疗，以及需要应用gnrh类似物治疗的性早熟和氢化可的松治疗疾病的骨成熟度的反应。
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